La regulación en células eucariotas es mucho más compleja que en procariotas, especialmente cuando se trata de pluricelulares. Cuando una célula se diferencia en un tipo concreto genera proteínas específicas que la hacen distinta estructural y funcionalmente. Para todo ello debe desactivar ciertos genes y activar otros. Cualquier célula posee en su núcleo todo el ADN de ese individuo. Las células procedentes del cigoto sufren diferenciación hacia las distintas líneas celulares adultas:
Nerviosas, musculares, epiteliales y conectivas.